Dalla seconda posizione in griglia, come accennato, partirà Marco Simoncelli sulla Honda ufficiale del team Gresini staccato di 133 millesimi e vittima di una caduta nel giro finale che gli è costata la pole position: il pilota romagnolo, a meno di gravi errori, sarà sicuro protagonista del Gran Premio di domani dimostrando nell’arco del week-end di essere molto veloce sul circuito lusitano se non il favorito alla vittoria finale. A completare la prima fila la Honda del team ufficiale Repsol di Dani Pedrosa che ha ottenuto la sua migliore prestazione in 1:37.324 che ha avuto la meglio rispetto al compagno di box Casey Stoner di soli 60 millesimi. L’australiano partirà dunque dalla quarta piazza e ha preceduto Ben Spies sulla seconda Yamaha e Andrea Dovizioso sull’altra Honda Repsol.
In ombra ancora una volta Valentino Rossi con una Ducati che ieri aveva solo illuso. Il sette volte campione del mondo MotoGP/500 ha chiuso le qualifiche con il nono tempo alle spalle anche delle due Yamaha private di Colin Edwards e Cal Crutchlow e staccato di un secondo e un decimo dalla vetta. In ogni caso quella di Rossi è la prima Ducati in griglia seguita immediatamente da quella di Hector Barbera mentre è addirittura 13esimo a un secondo e 7 decimi di distanza Nicky Hayden. Domani alle 14:00 la gara che è a rischio pioggia.
Griglia di partenza
| Pos. | Pilota | Team | Tempo | Gap |
| 1. | YAMAHA | 1:37.161 | ||
| 2. | HONDA | 1:37.294 | +0.133 | |
| 3. | HONDA | 1:37.324 | +0.163 | |
| 4. | HONDA | 1:37.384 | +0.223 | |
| 5. | YAMAHA | 1:37.866 | +0.705 | |
| 6. | HONDA | 1:38.073 | +0.912 | |
| 7. | DUCATI | 1:38.080 | +0.919 | |
| 8. | YAMAHA | 1:38.189 | +1.028 | |
| 9. | DUCATI | 1:38.271 | +1.110 | |
| 10. | DUCATI | 1:38.363 | +1.202 | |
| 11. | HONDA | 1:38.497 | +1.336 | |
| 12. | DUCATI | 1:38.786 | +1.625 | |
| 13. | DUCATI | 1:38.992 | +1.761 | |
| 14. | DUCATI | 1:38.934 | +1.773 | |
| 15. | SUZUKI | 1:39.172 | +2.011 | |
| 16. | DUCATI | 1:39.378 | +2.217 | |
| 17. | HONDA | 1:39.894 | +2.733 |